Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tubb1A2AQ07 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms