Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rhox3fA2ANE1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhox3fA2ANE1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms