Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Frmpd1A2AKB4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Frmpd1A2AKB4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms