Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pramel3A2AHA7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms