Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
4930447F04RikA2AFR2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.4 ms