Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
1700023F06RikA2AB62 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700023F06RikA2AB62 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms