Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prdm16A2A935 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prdm16A2A935 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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