Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sppl2cA2A6C4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sppl2cA2A6C4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms