Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cul4bA2A432 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms