Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms