Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms