Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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