Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv1A0A0B4J1G7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms