Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv15A0A0A6YYE3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv15A0A0A6YYE3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv15A0A0A6YYE3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv15A0A0A6YYE3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv15A0A0A6YYE3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv15A0A0A6YYE3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv15A0A0A6YYE3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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