Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms