Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
EPHB4P54760 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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