Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csmd2V9GX34 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Csmd2V9GX34 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd2V9GX34 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd2V9GX34 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd2V9GX34 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd2V9GX34 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd2V9GX34 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd2V9GX34 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd2V9GX34 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd2V9GX34 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd2V9GX34 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd2V9GX34 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Csmd2V9GX34 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Csmd2V9GX34 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms