Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc166S4R181 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc166S4R181 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms