Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Mbd4Q9Z2D7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mbd4Q9Z2D7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms