Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
VarsQ9Z1Q9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms