Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddx39bQ9Z1N5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ddx39bQ9Z1N5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms