Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NfkbiaQ9Z1E3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms