Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Setbp1Q9Z180 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setbp1Q9Z180 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms