Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NgfrQ9Z0W1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NgfrQ9Z0W1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms