Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cldn9Q9Z0S7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cldn9Q9Z0S7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cldn9Q9Z0S7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cldn9Q9Z0S7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cldn9Q9Z0S7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cldn9Q9Z0S7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cldn9Q9Z0S7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cldn9Q9Z0S7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn9Q9Z0S7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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