Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn13Q9Z0S4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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