Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cib1Q9Z0F4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cib1Q9Z0F4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms