Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pmfbp1Q9WVQ0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms