Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Pfdn5Q9WU28 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pfdn5Q9WU28 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pfdn5Q9WU28 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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