Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nfe2l3Q9WTM4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nfe2l3Q9WTM4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nfe2l3Q9WTM4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nfe2l3Q9WTM4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nfe2l3Q9WTM4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Nfe2l3Q9WTM4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nfe2l3Q9WTM4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nfe2l3Q9WTM4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms