Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slit2Q9R1B9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slit2Q9R1B9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms