Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod3Q9R0E1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plod3Q9R0E1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms