Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d3cQ9QZS8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms