Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col4a3Q9QZS0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col4a3Q9QZS0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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