Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ercc4Q9QZD4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms