Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms