Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnnt3Q9QZ47 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnnt3Q9QZ47 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms