Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Irx4Q9QY61 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms