Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp3Q9QY23 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms