Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ehd3Q9QXY6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ehd3Q9QXY6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ehd3Q9QXY6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ehd3Q9QXY6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ehd3Q9QXY6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ehd3Q9QXY6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ehd3Q9QXY6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ehd3Q9QXY6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms