Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Kcnip3Q9QXT8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Kcnip3Q9QXT8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Kcnip3Q9QXT8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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