Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trp53inp1Q9QXE4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trp53inp1Q9QXE4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms