Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clca3a1Q9QX15 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms