Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tcea2Q9QVN7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tcea2Q9QVN7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms