Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cdkl2Q9QUK0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms