Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Csnk1eQ9JMK2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csnk1eQ9JMK2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms