Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms