Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpc4apQ9JLV2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpc4apQ9JLV2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms