Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Aldh9a1Q9JLJ2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms