Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CubnQ9JLB4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CubnQ9JLB4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CubnQ9JLB4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CubnQ9JLB4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CubnQ9JLB4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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CubnQ9JLB4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CubnQ9JLB4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CubnQ9JLB4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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CubnQ9JLB4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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CubnQ9JLB4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CubnQ9JLB4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms